خانه درباره راهکارها همکاری تماس namjoo.org English
راهکار

Pipelineهای زیست‌شناسی محاسباتی

طراحی pipelineهای محاسباتی و بازتولیدپذیر برای پردازش و تحلیل داده‌های زیستی.

طراحی pipelineهای محاسباتی و بازتولیدپذیر برای پردازش و تحلیل داده‌های زیستی.

Pipelineها می‌توانند پیش‌پردازش، کنترل کیفیت، ابزارهای تحلیلی، مدل‌های یادگیری ماشین، پایگاه داده، مدیریت workflow و گزارش‌دهی را ترکیب کنند.

این pipelineها برای workflowهای ژنومی، transcriptomics، پروتئین، بوم‌شناسی و سایر مسائل زیست‌شناسی محاسباتی کاربرد دارند.

روش پیاده‌سازی بر اساس داده‌های موجود، محدودیت‌های فنی، میزان اتوماسیون مورد نیاز و زیرساخت نرم‌افزاری یا پژوهشی پروژه انتخاب می‌شود. راهکار می‌تواند به‌صورت یک جزء مستقل یا درون یک سامانه بزرگ‌تر پیاده‌سازی شود.

هدف، ایجاد یک جریان محاسباتی روشن و قابل ارزیابی است که بتوان آن را در ادامه نگهداری، توسعه و با نیازهای جدید پروژه تطبیق داد. بنابراین انتخاب مدل، پردازش داده، رابط‌ها و روش استقرار بر اساس مسئله واقعی پروژه تعیین می‌شود.